ФНС России в письме от 28.12.2022 № СД-4-3/17675@ указала, что при переходе с упрощенной системы налогообложения с объектом налогообложения в виде доходов на общий режим налогообложения налогоплательщики вправе применять вычет по НДС в соответствии с п. 6 ст. 346.25 НК РФ.
Этот вывод основан на правовой позиции, изложенной в Определении СКЭС Верховного Суда РФ от 24.05.2021 № 301-ЭС21-784. Суд пришел к выводу, что ни глава 21 Кодекса, ни статья 346.25 Кодекса, определяющие правила налогообложения при переходе налогоплательщика на общую систему налогообложения с упрощенной системы налогообложения, в том числе с объектом налогообложения в виде доходов, не содержат запрета на вычет сумм НДС, предъявленных в период применения специального налогового режима по товарам (работам, услугам), использование которых в облагаемой НДС деятельности начато после перехода на общую систему налогообложения.
Налоговая служба напомнила, что ранее применение вычета по НДС возможно было только при переходе с УСН с объектом налогообложения в виде доходов, уменьшенных на величину расходов (письма Минфина России от 01.09.2017 № 03-07-11/56374, от 07.04.2020 № 03-07-11/27295, Определения Верховного Суда РФ от 28.03.2016 № 305-КГ16-1570, от 18.04.2017 № 309-КГ17-3713, от 13.07.2018 № 308-КГ18-9088).
