Минфин России в письме от 26.05.2025 № 03-07-08/51297 напомнил, что налогоплательщик вправе отказаться от освобождения от налогообложения НДС при осуществлении операций по реализации товаров (работ, услуг), предусмотренных п. 3 ст. 149 НК РФ.
Освобождение от обложения НДС при передаче исключительных прав на программы для ЭВМ и базы данных, включенные в единый реестр российских программ для ЭВМ и баз данных, прав на использование таких программ и баз данных установлено подп. 26 п. 2 ст. 149 НК РФ.
Таким образом, право на отказ налогоплательщика от освобождения от налогообложения налогом на добавленную стоимость при передаче исключительных прав на программы для ЭВМ и базы данных, включенные в Реестр, положениями не предусмотрено.
Однако в случае выставления налогоплательщиками при реализации товаров (работ, услуг), операции по реализации которых не подлежат налогообложению, покупателю счетов-фактур с выделением сумм налога на добавленную стоимость суммы налога, подлежащие уплате в бюджет, определяются как суммы налога, указанные в этих счетах-фактурах, переданных покупателю данных товаров (работ, услуг) — подп. 2 п. 5 ст. 173 НК РФ.